分居期间子女抚养权的确定，同样遵循最有利于未成年子女的原则。法院会综合考虑多种因素，包括子女的年龄、意愿，父母双方的抚养能力、抚养条件、与子女的感情联系等。对于不满两周岁的子女，一般以由母亲直接抚养为原则，但如果母亲存在严重疾病、不尽抚养义务等不利于子女成长的情形，也可能判决由父亲抚养。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，法院会根据双方具体情况进行判断。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。在分居期间，若一方实际照顾子女较多，且能提供稳定的生活、学习环境，在争取抚养权时具有一定优势。​

案例：孙某和李某分居时，女儿已满 5 岁。分居期间，孙某一直陪伴女儿生活，负责其日常生活起居和学习辅导，李某因工作繁忙，与女儿相处时间较少。后来双方就女儿抚养权产生争议并诉至法院。孙某向法院提供了女儿的生活照片、学习成绩报告、幼儿园老师关于其照顾女儿的证明等，证明自己更适合抚养女儿。法院经审理，考虑到孙某在分居期间对女儿的实际照顾以及女儿与孙某的感情，判决女儿由孙某直接抚养，李某支付抚养费。​

法律分析：《民法典》关于子女抚养权的规定，核心目的是保障未成年子女的健康成长。在分居情境下，法院会结合分居期间的实际情况，综合判断哪一方能为子女提供更有利的成长条件。​

律师建议：想要争取子女抚养权的一方，在分居期间要注重履行抚养义务，多陪伴子女，记录下与子女相处的点滴，如亲子活动照片、视频等。同时，要积极改善自身的抚养条件，如提升经济收入、改善居住环境等，并收集相关证据，以便在抚养权争议中占据有利地位。​